1940–1941 ir 1944–1990 

Pirmoji sovietinė okupacija (1940–1941) 

1940 metais prasidėjus sovietinei okupacijai IX forte, prieš išsiunčiant į tremtį atokiose Sovietų Sąjungos vietovėse, buvo kalinami politiniai kaliniai. Ekspozicijoje lankytojai gali susipažinti su IX forte šiuo laikotarpiu kalėjusių žymių Lietuvos visuomenės veikėjų – inžinieriaus Juozo Enčerio, mokytojo Kazimiero Baršausko, Lietuvos jaunųjų ūkininkų ratelių vadovo Vlado Tiškaus, vieno iš Lietuvos prekinio laivyno kūrėjų Teodoro Reingardo, filosofijos mokslų daktaro ir žurnalisto Prano Dielininkaičio bei kitų asmenų kaltinimo bylomis, dokumentais, nuotraukomis iš kalinimo vietų, sovietų lageriuose rašytais laiškais ir kitais asmeniniais daiktais.

Antroji sovietinė okupacija (1944–1990) 

Ekspozicija rengiama.